功能不同
醫用防護服是臨床醫務人員在接觸甲類或按甲類傳染病管理的傳染病患者時所穿的醫用防護用品。隔離衣是用于醫務人員在接觸避免受到血液、體液和其他感染性物質污染，或用于保護患者避免感染的防護用品。
使用者指征不同
1、接觸經接觸傳播的感染性疾病患者如傳病病患者、多藥耐藥菌感染患者等時。
2、對患者實行保護性隔離時，如大面積燒傷患者、骨隨移植患者的診療、護理時。
3、可能受到患者血液、體液、分泌物、排匯物噴濺時。
4、進入重點部門如ICU、NICU、保護性病房等，是否需穿隔離衣，應視醫務人員進入目的及與患者接觸狀況，夠的內部規定。
接觸經空氣傳播和飛沫傳播的傳染病患者，可能受到患者血液、體液、分泌物、排匯物噴濺時。
使用對象不同
醫用防護服是防止醫護人員被感染，屬于單向隔離，主要針對的醫護人員；而隔離衣是既防止醫護人員被感染或污染又防止病人被感染，屬于雙向隔離。
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